哈爾濱醫科大學口腔學醫院是一所集醫療、教學、科研為一體的具有專科特色的臨床學院，其前身為創建于1958年的哈醫大口腔醫學系，是中國最早創建的口腔醫學系之一，也是東北地區第一個口腔醫學系。經過幾代人的不懈努力，幾十年來不斷發展壯大，于1999年成立了口腔醫學院。

哈爾濱醫科大學口腔醫學為黑龍江省重點學科，口腔臨床醫學是二級學科博士學位授權點，口腔醫學是一級學科碩士學位授予點，口腔醫學專業為黑龍江省重點專業,擁有黑龍江省口腔用生物醫學材料工程研究中心、中俄口腔生物醫學研究所等科研轉化平臺。口腔醫學院是國家唇腭裂診治聯盟單位、黑龍江省專業綜合改革試點項目單位、黑龍江省唇腭裂診療中心、黑龍江省言語殘疾人員等級評定與治療定點單位，黑龍江省牙體牙髓病醫療專科（業）質控中心，學科特色鮮明，科研方向和臨床、教學工作目標明確。師資力量雄厚，擁有教職工147人，教師112人，其中高級職稱占50%以上，博士研究生導師4人，碩士研究生導師30人，擁有碩士、博士學位教師達98%。現每年招收博士研究生4-5名，碩士研究生40-45名，本科生50名，進修生70-80名，成人教育學生80名，招生范圍面向全國，已培養了博士研究生30余名，碩士研究生400余名，本科生千余名，是黑龍江省口腔醫學教育、醫療、科研的中心，為國家貢獻了大批高級口腔醫學人才，為東北地區的教育、學術、口腔醫療水平的提高做出了突出的貢獻。

口腔醫學院設有牙體牙髓病學、兒童口腔醫學、口腔預防醫學、牙周病學、口腔修復學、口腔正畸學、口腔頜面外科學、口腔種植學、口腔頜面醫學影像學、口腔組織病理學、口腔解剖生理學等學科，現有牙科綜合治療椅100臺，病床80張，擁有錐形束CT、根管顯微鏡、熱牙膠充填系統、數字曲面體層X線機、數字頭影測量X線機等先進的醫療設備。

口腔醫學院大力開展國內外的交流與合作，先后與日本、美國、澳大利亞、俄羅斯等國家的多所著名院校以及國內的上海交大、武大、華西、北醫等建立友好院校協作關系。每年接待多位國內外著名學者前來講學和開展合作研究，同時也選派青年學術骨干和優秀研究生赴國外學習和交流。口腔醫學院具有較強的科研實力，主要研究方向有“唇腭裂綜合診療研究”、“牙源性干細胞及組織工程學研究”、“口腔頜面部腫瘤機理研究”和“口腔材料及藥物研究和臨床應用”，近年承擔國家級和省部級科研項目150項，取得多項省部級科研成果。