哈爾濱醫科大學生物信息科學與技術學院前身為創建于1981年的醫用數學教研室，2004年建立生物信息學系，2008年建院至今。生物信息科學與技術學院現有教師73人，其中教授9人，副教授30人，我國著名生物信息學家、龍江學者李霞教授任院長。

目前生物信息科學與技術學院具有生物醫學工程和生物學兩個一級學科博士點，是黑龍江省一級學科重點學科、省領軍人才梯隊、省研究生導師創新團隊單位。生物信息科學與技術學院生物信息學科依托生物醫藥省部共建國家重點實驗室，是黑龍江省重點學科、黑龍江省211項目重點建設學科、哈爾濱醫科大學國家重點學科培育學科，在國內外享有較高的聲譽。生物信息科學與技術學院下設生物信息學、系統生物學、生物數學、生物物理學、統計遺傳學、藥物基因組信息學、生物醫學軟件工程、生物醫學工程、表觀遺傳學和計算生物不10個教研室，學科門類齊全、研究方向和硬件設施完備，已經形成國內最大規模的生物信息學科研、教學團體。

生物信息科學與技術學院是國內最早從事生物信息學科學研究的單位之一，科研水平處于國內院校前列，重大疾病的生物信息學與計算系統生物學研究獨具特色，在復雜疾病的風險標志物識別、非編碼RNA的功能與作用機制研究、疾病風險基因定位與通路重構、疾病表觀遺傳改變機制研究、藥物靶標識別與計算機輔助藥物設計、新一代測序技術數據拼裝與分析、基因芯片數據分析與算法開發，及分子生物學軟件與平臺開發等領域取得突出成就。在Nucleic Acid Research(IF 10.18)、Briefings in Bioinformatics（IF 9.28)、Human Mutation(IF 5.96)、Molecular cancer Therapeutics(IF 5.23)、Bioinformatics(IF 5.04)等國際著名生物醫學和生物信息學期刊發表高水平SCI論文300余篇，其中影響因子5以上論文近百篇；主持國家863項目、國家重大研究計劃、973前期項目、國自然重大研究計劃等國家重大課題43項，其他各類課題百余項，年均研究經費超過500萬元；先后獲得省自然科學二等獎3項，中華醫學科技三等獎3項，廳局級獎30余項。

生物信息科學與技術學院是國內最早招收生物信息學和生物醫學軟件工程專業研究生和本科生的單位之一，主持建立的計算生物學教育教學體系已經成為全國生物信息學教學模板，計算生物醫學教育教學和人才培養水平處于國內領軍地位。生物信息科學與技術學院（系）自2001年起招收博、碩士研究生，2003年招收本科學生，為國內外生物醫學研究和生物醫藥產業輸送了大批優秀人才。目前已畢業博、碩士研究生230余人，連續10年一次就業率100%，絕大部分學生就讀國內外著名高校博士、博士后或于國內重點高校任教，已成為各大院校的骨干力量。生物信息科學與技術學院是國家首部《生物信息學》規劃教材主編單位（李霞教授任主編），目前招收生物技術（生物醫學軟件工程方向）、生物信息學和生物醫學工程（藥物組學信息學方向）三個本科專業，學生培養質量和數量均居國內前列，畢業學生供不應求，大部分學生赴中科院所、國內著名高校、著名生物企業等單位深造或就業。目前，生物信息科學與技術學院在讀博士生21人，碩士生110人，八（七）年制學生16人，本科學生563人，形成學科發展堅實的后備力量。

哈爾濱醫科大學生物醫學大數據研究中心掛靠我院，是生物信息科學與技術學院開展對外合作交流的窗口，近年來，開發大量具有實用價值的資源平臺和軟件工具。生物信息科學與技術學院注重科研項目的產業轉化，形成大批具有自主知識產權的研究成果，與中科院生物物理所、遺傳所、上海生科院生物信息中心、醫科院腫瘤研究所、同濟大學、首都醫科大學、第四軍醫大學、中南大學、南京醫科大學、天津醫科大學、哈爾濱工業大學、東北農業大學、華大基因組研究院、博奧、東軟等生命科學、臨床醫學、制藥產業、農林研究、生物科技和軟件產業領域單位形成良好的合作與人才交流關系，并面向全國，開展廣泛的科研交流和培訓工作。