牧醫工程學院是河南農業大學歷史悠久、積淀豐厚和特色鮮明的教學研究型學院。

牧醫工程學院溯源于河南公立農業專門學校，1913年招收蠶科預科班學生，1914年設立蠶桑專業，1927年招收畜牧專業學生，1929年設立畜牧系。1930年改為省立河南大學農學院畜牧系。1938年河南大學農學院畜牧系部分師生并入陜西武功國立西北農林專科學校。1939年河南大學農學院畜牧系與國立西北聯合大學農學院、國立西北農林專科學校合并，成立國立西北農學院。1949年河南大學重建，設農學院畜牧獸醫系。1952年全國高校院系調整時，畜牧專業并入華中農學院，獸醫專業并入江西農學院，河南農學院獨立建院，保留畜牧獸醫教研室。1958年學校恢復畜牧獸醫專業。1959 年恢復畜牧獸醫系。1993年畜牧獸醫系更名為畜牧獸醫工程學院。

長期以來，牧醫工程學院秉承“剛健篤實、輝光日新”的院訓，弘揚“團結奮進、力爭上游、遵從集體、愛我牧醫”的牧醫精神和“個人爭先進、團體爭第一”的院風，勤儉辦學，團結奮斗，求真務實，開拓進取，不斷壯大，逐步發展成為積淀豐厚，特色鮮明，充滿活力的教學研究型學院。

牧醫工程學院現有預防獸醫系、臨床獸醫系、基礎獸醫系、動物營養與飼料科學系、動物遺傳育種與繁殖科學系、動物生產系統與工程系、動物生物系和中心實驗室等8個教學單位；畜牧站、禽病研究所、動物醫院、鄭州教學實習基地、原陽教育實習基地和許昌動物醫學與動物科學實踐教學基地等6個校內實踐教學基地；設有生物工程（紹骙實驗班，一本）、生物工程、動物醫學、動物科學、藥物制劑、動物科學（動物營養工程）、動植物檢疫（動物檢疫）和水產養殖學等8個本科專業或方向。其中，動物醫學專業為國家一類特色專業，動物科學專業為省名牌專業。

目前，牧醫工程學院擁有1個省優勢學科—獸醫學，3個省一級重點學科—畜牧學、獸醫學、草學；6個省二級重點學科—動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、特種經濟動物營養、基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學；1個國家級動物科學實驗教學示范中心；2個博士后科研流動站—畜牧學博士后科研流動站、獸醫學博士后科研流動站；1個一級博士學位授權點—獸醫學，4個二級博士學位授權點—基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學、畜牧學；3個一級碩士學位授權點--獸醫學、畜牧學、草學；12個二級碩士學位授權點--基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學、人獸共患病學、獸醫生物技術、動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、特種經濟動物飼養、動物生產系統與工程、水產經濟動物健康養殖、牧草營養與利用、飼草生產與加工；2個在職專業碩士授權點—農業推廣碩士、獸醫碩士。形成了以本科生教育為基礎，具有培養學士、碩士、博士及博士后等層次完整的人才培養體系。在校本科生1900余人，碩士生、博士生370余人。

以我院為主建有現代畜牧業河南省協同創新中心、農業部動物生化與營養重點實驗室、河南省動物性食品安全重點實驗室、河南省家禽種質資源創新工程研究中心、河南省動物生長發育調控重點實驗室、河南省人獸共患病國際聯合實驗室、飼料營養河南省工程實驗室、河南省家禽育種國際聯合實驗室、動物生物制品河南省工程實驗室、河南省家禽育種工程技術研究中心等省部級科研教學平臺11個，鄭州市食源性病原體檢測重點實驗室、鄭州市飼料營養重點實驗室等地廳級科研教學平臺8個。

實施人才強院戰略，努力建設一流師資隊伍。現有教職工140人，其中專任教師113人。教師隊伍中教授40人，副教授40人，具有博士學位的教師98人；中國工程院院士1人，國家杰出青年科學基金獲得者1人，談家楨生命科學產業化獎獲得者1人，中原學者3人，國家現代農業產業技術體系崗位科學家6人，國家百千萬人才工程3人，農業部農業科技杰出人才3人，“大地學者”特聘教授1人，省、校特聘教授5人，省級學術和技術帶頭人7人，省級教學名師2人，校級教學名師5人。客座（兼職）教授17人。中國科學院院士吳常信和中國工程院院士陳煥春、黃路生為我院雙聘院士。先后有6人被評為享受國務院政府特殊津貼專家，6人分別榮獲全國教育系統勞動模范、全國師德先進個人、全國模范教師、新世紀百千萬人才工程國家級人選、全國先進工作者和全國優秀科技工作者等國家級榮譽。獲得教育部創新團隊1個、農業部創新團隊1個、河南省教學創新團隊3個、河南省創新型科技團隊3個。

堅持以“高素質復合型人才”為培養目標，深化教學改革，優化育人環境。“十五”以來，3項成果獲得國家級教學成果二等獎，2門課程先后被評為國家級精品資源共享課。2002年成立了河南省首家大學生創業中心，2008年設立大學生科技創新基金，累計注資80萬元，鼓勵和支持大學生開展創新創業活動。堅持舉辦“三大教育”工作坊、學先進做模范特色黨日活動、企業家課堂、博學講堂、大學生課外學術作品競賽、杰出校友故事分享等特色品牌活動。自1993年以來，14次參加“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽和創業計劃競賽并獲獎，其中2011年獲得國家級一等獎，成為學校參賽以來獲得的最高榮譽。1個學生科技創新團隊被評為全國首批大學生“小平科技創新團隊”，也是學校唯一一個獲此殊榮的學生團隊。2位學生分別榮獲首屆、第五屆中國青少年科技創新獎。獲全國動物醫學專業技能大賽特等獎、水族箱造景大賽二等獎、動物科學專業技能大賽三等獎。自1988年以來，28次問鼎校運會學生團體冠軍。10多家企業在牧醫工程學院設立獎（助）學金累計300余萬元。畢業生就業率保持在98%以上，考研率在40%左右。多次被評學校評為學生工作先進單位、社會實踐活動先進單位、校園文化活動先進單位、基礎文明創建工作先進單位等。

注重提升科技創新能力，著力建設大團隊、爭取大項目、培育大成果、推進大轉化。 “十五”以來，先后主持國家自然科學基金重大項目、國家“863”計劃、國家“948”計劃重點項目、國家科技支撐計劃、國家重點研發計劃、國家自然科學基金等省部級以上重大、重點項目100多項。獲科技成果省部級二等獎及以上21項，其中，國家技術發明獎二等獎1項、國家科學技術進步獎二等獎1項。國家技術發明專利授權48項；獲國家新獸藥證書11個，轉讓14個（轉讓企業21家，占全國高校禽類疫苗51%），轉讓經費超億元。

堅持開放辦學，加強對外交流與合作，不斷提升牧醫工程學院的知名度和影響力。先后與美國、英國、德國、日本、韓國、澳大利亞、荷蘭等國10多所大學建立合作關系。近五年來，承辦國際和全國性學術會議17次，接待國內外兄弟院校考察交流團39個，每年有200多人次參加國內外學術活動，鼓勵教師到國內外知名高校學習或合作研究；與60余家農業產業化龍頭企業建立了合作關系；與省農業廳、畜牧局合作培訓行業技術骨干4000余人，為地方經濟發展做出了重要貢獻。目前有5人兼任國家級學術團體專業分會副理事長職務，9個省級學會（分會）掛靠牧醫工程學院。

牧醫工程學院高度重視黨建與思想政治工作，努力構建和諧學院，先后被授予“全省‘五好’基層黨組織”、“河南省高等學校先進基層黨組織”等榮譽稱號。