自1952年全國高校院系調整后，東南大學就開始招收研究生，20世紀50年代后期至60年代初期共招收研究生117人，1978年恢復招收研究生。1981年實施學位條例后，首批獲學士、碩士、博士學位授予權；首批建有博士后流動站的單位；首批進入國家“985工程”和“211工程”；是自行審批博士和碩士學位授予權、自行審定增列博士生指導教師的試點單位；首批獲準招收和培養(yǎng)工程碩士生；首批獲準開展工程博士專業(yè)學位授予工作。1986年4月經國務院批準試辦研究生院，1996年3月經國家教委批準，正式建立研究生院。東南大學與國內許多重點高校一樣，已成為我國研究生教育與培養(yǎng)的一個重要基地。    

東南大學現(xiàn)有專任教師2700余人，具有博士學位的教師2222人，占教師總數(shù)的比例為80.3％，正、副高級職稱1900余人，博士生指導教師833人，碩士生指導教師1875人，兩院院士13人，國務院學位委員第七屆學科評議組成員13人，入選國家“萬人計劃”專家16人，入選國家“千人計劃”專家43人，“長江學者獎勵計劃”特聘教授、講座教授43人，長江學者青年項目5人，國家級教學名師獎獲得者5人，“萬人計劃”教學名師3人,國家杰出青年科學基金獲得者43人。30個博士學位授權一級學科點，49個碩士學位授權一級學科點，覆蓋了13個學科門類中的哲學、經濟學、法學、教育學、文學、理學、工學、醫(yī)學、管理學、藝術學等10個門類。截至2016年6月， 已授予博士學位6219名，碩士學位50158名。

在東南大學研究生院改革與發(fā)展的進程中，我們始終注重學科建設水平和研究生培養(yǎng)質量的提高：比照國際學科，提高學科水平

在東南大學創(chuàng)建世界一流大學發(fā)展目標的驅動下，東南大學的優(yōu)勢學科確立了以世界一流學科為標桿建設高峰學科的目標，如生物醫(yī)學工程學科以美國杜克大學的相應學科為標桿、交通運輸工程學科以美國伊利諾伊大學香檳分校的相應學科為標桿、建筑學學科在科學研究和教學上分別以MIT和ETHZ的相應學科為標桿，這些學科在國際化環(huán)境中努力提升學科的國際地位，學科建設水平得到了整體提升。截至2016年9月，工程學、材料科學、數(shù)學、物理學、化學、臨床醫(yī)學、計算機科學、生物與生物化學、藥理學與毒理學等9個學科進入ESI世界前1%，其中工程學位列44位、計算機科學位列71位。

經過“985工程”、“211工程”和江蘇高校優(yōu)勢學科建設工程的重點建設，東南大學學科結構不斷完善、學科競爭力持續(xù)提升。現(xiàn)有5個一級學科國家重點學科（涵蓋15個二級學科），5個二級學科國家重點學科，1個國家重點（培育）學科，13個江蘇高校優(yōu)勢學科建設工程二期項目立項學科（群），1個江蘇省重點序列學科，12個江蘇省一級學科重點學科。在2012年第三輪全國學科評估中，15個學科進入前20%，有12個學科進入全國前七位，有10個學科位列全國前五位，排名第一的學科數(shù)并列全國高校第七位，其中生物醫(yī)學工程、交通運輸工程、藝術學理論等3個學科位列全國第一位，建筑學、電子科學與技術、風景園林學等3個學科位列全國第二位，土木工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學等2個學科位列全國第三位，信息與通信工程位列第四位，儀器科學與技術位列第五位，動力工程及工程熱物理位列第六位，公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學位列第七位。另外，控制科學與工程躍升至第十一名，哲學躍升至第十三名，管理科學與工程躍升至第十三名，排名江蘇省第一。

為了進一步集聚優(yōu)質學科資源、優(yōu)化學科布局，努力創(chuàng)建學科群協(xié)同發(fā)展的優(yōu)勢，東南大學組建了理學部、人文社會科學學部、生命科學與醫(yī)學部、土建交通學部、信息電子學部、機能材化學部和電儀控制學部等七大學部，揭開了我校從關注學科數(shù)量向注重加強學科質量方向轉移的序幕，為東南大學創(chuàng)建世界一流大學奠定了堅實的基礎。二、創(chuàng)新教育模式，提高培養(yǎng)質量

研究生教育的核心使命在于培養(yǎng)滿足國家需要的高層次拔尖創(chuàng)新人才，問題的關鍵在于如何才能提高研究生的培養(yǎng)質量。經過二十多年的探索與實踐，東南大學研究生院堅持改革，持續(xù)創(chuàng)新教育模式，已經建立了一整套行之有效的研究生培養(yǎng)質量保障體系。

第一，多種措施并舉，吸引優(yōu)秀生源。優(yōu)秀生源是提高研究生培養(yǎng)質量的重要基礎。為了更加廣泛地吸引優(yōu)秀生源，東南大學采取了多種措施，優(yōu)化和完善推免生考核選拔機制；加大碩博連讀生選拔力度；合理調整設置考試科目，注重綜合素質和創(chuàng)新能力考核；健全機制，賦予導師充分的自主選拔權等。
第二，拓寬知識領域，改善知識結構。高層次拔尖創(chuàng)新人才不僅需要具有堅實的專業(yè)基礎知識，而且需要具有廣博的相關領域知識。為了順應現(xiàn)代科學技術發(fā)展的大趨勢，東南大學在加強通識教育的基礎上，積極探索寬口徑拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，努力為每一位研究生構建一個合理的知識結構。
第三，積極推進研究生教學改革，穩(wěn)步提升學位論文質量。在優(yōu)化課程體系、加強課程建設、轉變教學模式的基礎上，東南大學逐步建立健全了研究生教學質量檢查與評估體系，設立了優(yōu)秀博士論文基金及培育對象基金，鼓勵研究生在校期間刻苦學習、潛心研究，共獲全國優(yōu)秀博士學位論文16篇、提名28篇。
第四，完善國際化人才培養(yǎng)體系，努力培養(yǎng)具有國際視野的拔尖創(chuàng)新人才。在國際化視野下創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，加大對研究生出國學習交流的支持力度，大力推進聯(lián)合辦學。東南大學先后與法國雷恩一大、澳大利亞蒙納什大學等國際一流大學聯(lián)合培養(yǎng)研究生，在國際化辦學的強校道路上邁出了堅實的一步。在新的歷史機遇期，

東南大學確立了創(chuàng)建世界一流大學新“三步走”的發(fā)展目標，制定了堅定不移地走以創(chuàng)新為主導的研究型大學發(fā)展道路、堅定不移地走與國家和區(qū)域經濟建設和社會發(fā)展相結合的建設道路、堅定不移地走國際化辦學的強校道路的發(fā)展戰(zhàn)略，為了適應學科建設和研究生教育發(fā)展的新環(huán)境，研究生院正不斷深化改革，努力為探索創(chuàng)建世界一流大學積累新的經驗，力爭為我國學位與研究生教育做出新的更大的貢獻。