自1952年全國高校院系調(diào)整后，東南大學(xué)就開始招收研究生，20世紀50年代后期至60年代初期共招收研究生117人，1978年恢復(fù)招收研究生。1981年實施學(xué)位條例后，首批獲學(xué)士、碩士、博士學(xué)位授予權(quán)；首批建有博士后流動站的單位；首批進入國家“985工程”和“211工程”；是自行審批博士和碩士學(xué)位授予權(quán)、自行審定增列博士生指導(dǎo)教師的試點單位；首批獲準招收和培養(yǎng)工程碩士生；首批獲準開展工程博士專業(yè)學(xué)位授予工作。1986年4月經(jīng)國務(wù)院批準試辦研究生院，1996年3月經(jīng)國家教委批準，正式建立研究生院。東南大學(xué)與國內(nèi)許多重點高校一樣，已成為我國研究生教育與培養(yǎng)的一個重要基地。    

東南大學(xué)現(xiàn)有專任教師2700余人，具有博士學(xué)位的教師2222人，占教師總數(shù)的比例為80.3％，正、副高級職稱1900余人，博士生指導(dǎo)教師833人，碩士生指導(dǎo)教師1875人，兩院院士13人，國務(wù)院學(xué)位委員第七屆學(xué)科評議組成員13人，入選國家“萬人計劃”專家16人，入選國家“千人計劃”專家43人，“長江學(xué)者獎勵計劃”特聘教授、講座教授43人，長江學(xué)者青年項目5人，國家級教學(xué)名師獎獲得者5人，“萬人計劃”教學(xué)名師3人,國家杰出青年科學(xué)基金獲得者43人。30個博士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，49個碩士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，覆蓋了13個學(xué)科門類中的哲學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、法學(xué)、教育學(xué)、文學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、醫(yī)學(xué)、管理學(xué)、藝術(shù)學(xué)等10個門類。截至2016年6月， 已授予博士學(xué)位6219名，碩士學(xué)位50158名。

在東南大學(xué)研究生院改革與發(fā)展的進程中，我們始終注重學(xué)科建設(shè)水平和研究生培養(yǎng)質(zhì)量的提高：比照國際學(xué)科，提高學(xué)科水平

在東南大學(xué)創(chuàng)建世界一流大學(xué)發(fā)展目標的驅(qū)動下，東南大學(xué)的優(yōu)勢學(xué)科確立了以世界一流學(xué)科為標桿建設(shè)高峰學(xué)科的目標，如生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科以美國杜克大學(xué)的相應(yīng)學(xué)科為標桿、交通運輸工程學(xué)科以美國伊利諾伊大學(xué)香檳分校的相應(yīng)學(xué)科為標桿、建筑學(xué)學(xué)科在科學(xué)研究和教學(xué)上分別以MIT和ETHZ的相應(yīng)學(xué)科為標桿，這些學(xué)科在國際化環(huán)境中努力提升學(xué)科的國際地位，學(xué)科建設(shè)水平得到了整體提升。截至2016年9月，工程學(xué)、材料科學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、計算機科學(xué)、生物與生物化學(xué)、藥理學(xué)與毒理學(xué)等9個學(xué)科進入ESI世界前1%，其中工程學(xué)位列44位、計算機科學(xué)位列71位。

經(jīng)過“985工程”、“211工程”和江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程的重點建設(shè)，東南大學(xué)學(xué)科結(jié)構(gòu)不斷完善、學(xué)科競爭力持續(xù)提升。現(xiàn)有5個一級學(xué)科國家重點學(xué)科（涵蓋15個二級學(xué)科），5個二級學(xué)科國家重點學(xué)科，1個國家重點（培育）學(xué)科，13個江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程二期項目立項學(xué)科（群），1個江蘇省重點序列學(xué)科，12個江蘇省一級學(xué)科重點學(xué)科。在2012年第三輪全國學(xué)科評估中，15個學(xué)科進入前20%，有12個學(xué)科進入全國前七位，有10個學(xué)科位列全國前五位，排名第一的學(xué)科數(shù)并列全國高校第七位，其中生物醫(yī)學(xué)工程、交通運輸工程、藝術(shù)學(xué)理論等3個學(xué)科位列全國第一位，建筑學(xué)、電子科學(xué)與技術(shù)、風(fēng)景園林學(xué)等3個學(xué)科位列全國第二位，土木工程、城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)等2個學(xué)科位列全國第三位，信息與通信工程位列第四位，儀器科學(xué)與技術(shù)位列第五位，動力工程及工程熱物理位列第六位，公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)位列第七位。另外，控制科學(xué)與工程躍升至第十一名，哲學(xué)躍升至第十三名，管理科學(xué)與工程躍升至第十三名，排名江蘇省第一。

為了進一步集聚優(yōu)質(zhì)學(xué)科資源、優(yōu)化學(xué)科布局，努力創(chuàng)建學(xué)科群協(xié)同發(fā)展的優(yōu)勢，東南大學(xué)組建了理學(xué)部、人文社會科學(xué)學(xué)部、生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)部、土建交通學(xué)部、信息電子學(xué)部、機能材化學(xué)部和電儀控制學(xué)部等七大學(xué)部，揭開了我校從關(guān)注學(xué)科數(shù)量向注重加強學(xué)科質(zhì)量方向轉(zhuǎn)移的序幕，為東南大學(xué)創(chuàng)建世界一流大學(xué)奠定了堅實的基礎(chǔ)。二、創(chuàng)新教育模式，提高培養(yǎng)質(zhì)量

研究生教育的核心使命在于培養(yǎng)滿足國家需要的高層次拔尖創(chuàng)新人才，問題的關(guān)鍵在于如何才能提高研究生的培養(yǎng)質(zhì)量。經(jīng)過二十多年的探索與實踐，東南大學(xué)研究生院堅持改革，持續(xù)創(chuàng)新教育模式，已經(jīng)建立了一整套行之有效的研究生培養(yǎng)質(zhì)量保障體系。

第一，多種措施并舉，吸引優(yōu)秀生源。優(yōu)秀生源是提高研究生培養(yǎng)質(zhì)量的重要基礎(chǔ)。為了更加廣泛地吸引優(yōu)秀生源，東南大學(xué)采取了多種措施，優(yōu)化和完善推免生考核選拔機制；加大碩博連讀生選拔力度；合理調(diào)整設(shè)置考試科目，注重綜合素質(zhì)和創(chuàng)新能力考核；健全機制，賦予導(dǎo)師充分的自主選拔權(quán)等。
第二，拓寬知識領(lǐng)域，改善知識結(jié)構(gòu)。高層次拔尖創(chuàng)新人才不僅需要具有堅實的專業(yè)基礎(chǔ)知識，而且需要具有廣博的相關(guān)領(lǐng)域知識。為了順應(yīng)現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)發(fā)展的大趨勢，東南大學(xué)在加強通識教育的基礎(chǔ)上，積極探索寬口徑拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，努力為每一位研究生構(gòu)建一個合理的知識結(jié)構(gòu)。
第三，積極推進研究生教學(xué)改革，穩(wěn)步提升學(xué)位論文質(zhì)量。在優(yōu)化課程體系、加強課程建設(shè)、轉(zhuǎn)變教學(xué)模式的基礎(chǔ)上，東南大學(xué)逐步建立健全了研究生教學(xué)質(zhì)量檢查與評估體系，設(shè)立了優(yōu)秀博士論文基金及培育對象基金，鼓勵研究生在校期間刻苦學(xué)習(xí)、潛心研究，共獲全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文16篇、提名28篇。
第四，完善國際化人才培養(yǎng)體系，努力培養(yǎng)具有國際視野的拔尖創(chuàng)新人才。在國際化視野下創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，加大對研究生出國學(xué)習(xí)交流的支持力度，大力推進聯(lián)合辦學(xué)。東南大學(xué)先后與法國雷恩一大、澳大利亞蒙納什大學(xué)等國際一流大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)研究生，在國際化辦學(xué)的強校道路上邁出了堅實的一步。在新的歷史機遇期，

東南大學(xué)確立了創(chuàng)建世界一流大學(xué)新“三步走”的發(fā)展目標，制定了堅定不移地走以創(chuàng)新為主導(dǎo)的研究型大學(xué)發(fā)展道路、堅定不移地走與國家和區(qū)域經(jīng)濟建設(shè)和社會發(fā)展相結(jié)合的建設(shè)道路、堅定不移地走國際化辦學(xué)的強校道路的發(fā)展戰(zhàn)略，為了適應(yīng)學(xué)科建設(shè)和研究生教育發(fā)展的新環(huán)境，研究生院正不斷深化改革，努力為探索創(chuàng)建世界一流大學(xué)積累新的經(jīng)驗，力爭為我國學(xué)位與研究生教育做出新的更大的貢獻。