武漢大學研究生教育發端于1935年，至今已有80余年的歷史。1955年，武漢大學招收了新中國成立后的第一批研究生；1978年，重新恢復因"文革"中斷達10余年的研究生教育；1981年，成為國務院批準的首批博士、碩士學位授予單位；1984年，成為全國第一批試辦研究生院的高等學校之一。2002年，成為34所自行劃定復試分數線學校之一。

扎根于百年武大的深厚底蘊，積累了豐富的辦學經驗，形成了鮮明的辦學特色。目前，已建立一套學科門類齊全、學位類型多樣、導師隊伍雄厚、管理體制健全的學位與研究生教育體系。2016年12月，武漢大學召開了研究生教育工作會議，以完善研究生教育體制機制為著力點，以博士研究生教育綜合改革為牽引，強調原創研究、科學精神、社會責任，形成了“1個主文件+4個實施文件+X個后續文件”的制度體系，致力于培養具有“前瞻視野、健全人格、精深知識、創新思維”的優秀學者和行業精英。

武漢大學歷來高度重視導師隊伍建設，推行復合導師制，開辦“導師學校”、跨學科導師沙龍，提升導師指導水平；不斷完善導師管理機制。2012年，武漢大學大膽改革導師上崗招生制度，采取“評聘分離，動態上崗”方式，實現“博導”從身份管理向崗位管理的轉變。目前，武漢大學現有專任教師3820人，其中正高級職稱1243人、副高級職稱1478人，具有博士學位專任教師3005人，占教師總數的78.67%。專任教師中有中國科學院院士9名、中國工程院院士8名、人文社會科學資深教授11名，國家教學名師15名，國家杰出青年學者56名，長江學者講座及特聘教授86名，國家基金委創新研究群體5個。

武漢大學不斷深化研究生考試招生制度改革，提高生源質量。優化選拔方式，陸續推出了“直接攻博”、“碩博連讀”、“申請-考核”、“優秀人才單獨選拔”等招生考試方式，積極探索特色化研究生選拔機制。不斷創新招生宣傳方式，在全國率先舉辦研究生招生宣傳日，組織招生宣傳小組到全國重點高校進行招生宣傳，舉辦“優秀大學生暑期夏令營”活動等。不斷拓寬優秀生源選拔渠道，具備推免生資格的考生均可以申請被接收為推免生，還專門設立了優秀新生獎學金。不斷提高服務質量，維護公平公正，通過招生計劃分配模型配置招生計劃，嚴格執行國家有關研究生招生的政策規定，強化信息公開，主動接受考生和社會監督，保障機會公平、過程公開，結果公正。

在研究生培養方面，武漢大學實行以科學研究、知識創新和技術創新為主導的導師負責制并建立了新的研究生獎助體系。不斷創新培養模式，在學術型研究生中實施以直博生、“1+4”、“2+3”、“3+3”碩博連讀制度為主體的多元化貫通式培養方式，多維度搭建跨學科人才培養平臺。2011年，武漢大學在全國率先啟動了“博士研究生跨學科拔尖創新人才培養試驗區”項目，將國家級重大科研項目的研發融入到拔尖創新人才培養過程。此外，武漢大學一直貫徹人才培養中的科研導向原則，鼓勵研究生大膽創新，并不斷加大拔尖創新人才培養的投入力度；另一方面，通過與國外高水平大學簽訂聯合培養協議、參加國家公派出國留學等途徑，積極開拓國際化教育渠道，不斷提升研究生教育國際化水平。以高層次應用型創新人才培養試驗區為依托，積極構建以專業學位案例教學、實習實訓、行業前沿講座為主體的專業學位研究生培養模式，在國家設置的39種專業學位中，武漢大學可在31個專業學位類別、22個工程領域內招收和培養專業學位碩士研究生，總體規模位居全國前列。2014年起學校大幅提高了研究生獎助學金額度。獎學金方面，武漢大學設立了研究生國家獎學金，學業獎學金，新生獎學金，學術創新獎，以及40余項校友和企事業單位出資設立的專項獎學金，100%的全日制非定向就業學術型碩士、博士和專業型碩士均可獲得學業獎學金；研究生學術創新獎特等獎額度達到8萬元、一等獎5萬元、二等獎1.5萬元，覆蓋400名研究生；資助方面，武漢大學國家助學金標準為博士生每人每學年2.5萬元,2018年9月起將提高至每人每年2.7萬元；碩士生每人每學年0.6萬元。此外，武漢大學還設立了社會助學金、研究生三助崗位，臨時困難補助等多項資助方式。

加強研究生教育質量管理。2014年成立研究生教育質量管理處。按照“標準一流、制度先行、分類評價、動態監管”的工作原則，堅持“服務需求、提高質量、內涵發展”理念，構建了“以學校為主導、以培養單位為主體、研究生和導師共同參與”的學校內部研究生教育質量保障體系，質量意識不斷增強，形成了獨具特色的質量文化。按一級學科和專業學位類別分別制定博士碩士學位授予標準，完善各項研究生教育質量管理制度；以人才培養為核心，統籌學術學位和專業學位，定期開展自我診斷式評估；開展博士碩士學位論文抽檢工作；開展研究生教育科研績效評價，以績效為導向配置研究生教育資源；利用各類信息平臺，向社會公布研究生教育相關信息；開展質量跟蹤調查，聽取用人單位意見。

依托雄厚的辦學基礎和實力，武漢大學研究生教育逐步形成門類齊全、特色鮮明的學科體系，現有學科涵蓋了哲、經、法、教育、文、史、理、工、農、醫、管理、藝術等12個學科門類,設有人文科學、社會科學、理學、工學、信息科學和醫學六大學部35個學院（系）。5個一級學科、17個二級學科被認定為國家重點學科，6個學科為國家重點（培育）學科。44個一級學科具有博士學位授予權，55個一級學科具有碩士學位授予權，綜合實力位居全國高校前列。在教育部學位與研究生教育發展中心第三輪學科評估中，武漢大學4個一級學科排名全國第一，總數排名全國第6位；14個一級學科排名全國前五位，總數排名全國第7位。

進入新世紀，武漢大學研究生教育突出“創新”與“質量”兩大主題，按照“三類人才”標準，培養了一大批高層次、高素質、多樣性、創新型和國際化的拔尖人才，產生了一批具有國際先進水平的標志性成果，已成為國家學位與研究生有重要影響和示范作用的基地之一。截至2017年1月，學校共有在校碩士研究生15923人，博士研究生6608人，正在攻讀和已獲博士、碩士學位的人員中，有不少來自美國、英國、法國、德國、俄羅斯、日本、朝鮮、韓國、緬甸、尼日利亞等國的留學生。自2000年以來，武漢大學已畢業碩士生90000余人，授予碩士學位110000余人，授予博士學位13000余人，培養出一批對政治、經濟、社會發展做出突出貢獻的杰出人才。