西南交通大學研究生院創建于1984年12月，是國務院首批批準試辦的研究生院之一。西南交通大學等十所研究生院受到表彰，并正式掛牌。

作為全國重要的研究生培養基地，西南交通大學研究生院依托學校雄厚的辦學實力，為研究生的培養創造了良好的學科環境和師資條件。西南交通大學是目前國內學科門類最齊全的綜合性大學之一，可在哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、農學、醫學、管理學和藝術學等12個學科門類授予學術性學位。現擁有博士學位授權二級學科274個(含自主增設54個)，涉及一級學科56個，其中博士學位授權一級學科54個；碩士學位授權二級學科309個(含自主增設56個)，涉及一級學科61個，其中碩士學位授權一級學科60個；博士專業學位類別4種，碩士專業學位類別27種。現有14個一級學科國家重點學科、21個二級學科國家重點學科和10個國家重點（培育）學科，7個農業部重點學科，50個一流學科，形成了重點突出、層次分明、富有特色的重點學科系列。在國家公布的“雙一流”建設名單中，學校入選一流大學建設高校（A類），18個學科入選一流建設學科，居全國高校第三。

西南交通大學師資隊伍整體實力雄厚，現有中國科學院院士21人、中國工程院院士20人、國家“千人計劃”入選者（含青年項目）237人、文科資深教授9人、“973計劃”和重大科學研究計劃等首席科學家41人、教育部“長江學者獎勵計劃”入選者（含青年學者）101人、國家杰出青年科學基金獲得者129人。截至2017年12月31日，各學科具有研究生招生資格的教師為4046人，其中具有博士生招生資格的教師為2535人；具有專業學位碩士生招生資格的教師為2170人，其中具有專業學位博士生招生資格的教師為255人；副教授562人具有博士生招生資格。

目前擁有國家重點實驗室10個，國家（地方聯合）工程實驗室10個，重點學科實驗室1個，國家專業實驗室4個以及省部級實驗室102個；擁有國家工程技術研究中心4個，國家級協同創新中心2個以及省部級平臺中心、基地41個；擁有普通高等學校人文社科重點研究基地3個。高水平的研究生導師隊伍和良好的科研實驗條件，為開展高水平的研究生教育打下了堅實的基礎。

西南交通大學積極推動研究生教育國際化進程,已與多所世界著名高校建立了實質性的校際合作關系。西南交通大學十分注重拓展學生的國際視野，僅2017年，全校共選送2440名研究生通過多種渠道公派出國（境），攻讀學位、聯合培養、短期訪問、參加高水平國際學術會議等。

在長期的辦學過程中，西南交通大學以嚴謹的求是學風培養了大批優秀人才，以執著的創新精神創造出了豐碩成果。從1999年至2017年9月，西南交通大學共授予博士學位20565人，授予碩士學位90587人。共有48篇博士學位論文入選全國百篇優秀博士學位論文，93篇入選全國優秀博士學位論文提名獎。目前西南交通大學在校研究生28795名，其中博士研究生10747名，碩士研究生18048名（其中非全日制碩士研究生1530人）。2017年，招收博士研究生2497名，招收碩士研究生5987名，招收在職人員攻讀碩士學位研究生1572名。