東北農業大學農學院于1996年6月成立，由原農學系、植保系二系合并而成，是東北農業大學具有傳統優勢的骨干支柱學院。它的前身——農藝系創立于1948年，是學校最早設立的三系之一。目前農學院有4個系（農學系、植物保護系、種子科學與工程系、植物科學與技術系）；農學院設有1個一級學科博士點、2個二級學科博士點，設有1個博士后流動站；農學院有5個學科，均為碩士點學科，其中前四個為黑龍江省重點學科，后一個為校重點學科。農學院還設有農業部寒地作物生理生態重點開放實驗室、黑龍江省大豆生物學重點實驗室、作物品質分析中心、大豆研究所及12個研究中心和研究室。

農學院成立于1996年，是東北農業大學骨干學院之一。

農學院前身是1948年東北農學院建院時成立的三系之一 —— 農藝系（后改為農學系），招收農學專業學生，王金陵教授任首任系主任。

農學院現有在職教工116人，博士學位教師86人，正高職36人，副高職41人。博士研究生導師31人，碩士研究生導師57人。其中國務院特殊津貼獲得者3人、國務院學位委員會學科評議組成員1人，全國專業學位研究生教育指導委員1人，教育部高等學校教學指導委員會植物生產類教學指導委員會委員1人，世界大豆研究會執行委員會委員和北美大豆遺傳委員會執行組成員及中國作物學會大豆專業委員會副理事長1人，中國作物學會馬鈴薯專業委員會秘書長1人，兼職院士2人，科技部中青年領軍人才1人，農業部現代農業產業技術體系崗位科學家3人，農業科研杰出人才2人，龍江學者3人，教育部新世紀人才基金獲得者2人，黑龍江特殊津貼獲得者2人、黑龍江省杰出青年基金獲得者3人，香江學者1人，黑龍江省二級教授6人，黑龍江省長江學者后備支持計劃獲得者2人，黑龍江省新世紀人才4人，黑龍江省教育廳骨干教師8人，黑龍江省普通高等學校青年創新人才2人。東農“杰出學者”2人、“學術骨干”8人、青年才俊8人。[1]

“寒地大豆優質、多抗分子設計育種”團隊2009年入選[2]，2012年獲得教育部創新團隊培育計劃的支持；“寒地作物遺傳育種”研究生導師團隊2009年入選黑龍江省第二屆優秀研究生導師團隊；“有害生物綜合治理”教學團隊2009年入選黑龍江省優秀教學團隊。