福建醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院前身為福建醫(yī)學院衛(wèi)生系，始建于1959年，是我國早期開設預防醫(yī)學本科專業(yè)的少數(shù)院系之一。公共衛(wèi)生學院現(xiàn)有教職工81人，其中專任教師56人，教授、副教授30人，博、碩士生導師30余人，國務院特殊津貼專家2人，福建省高校教學名師2人，教師中博碩士比例占90%以上。公共衛(wèi)生學院現(xiàn)設有預防醫(yī)學系、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學系、營養(yǎng)與食品安全學系、衛(wèi)生檢驗與檢疫學系、衛(wèi)生管理學系、衛(wèi)生法學與衛(wèi)生政策學系等6個學系和實驗中心；設有公共衛(wèi)生與全科醫(yī)學人才培訓中心及福建省食品安全風險研究中心、福建醫(yī)科大學環(huán)境與健康研究所、衛(wèi)生政策研究中心等3個省校級研究機構(gòu)。

公共衛(wèi)生學院現(xiàn)有預防醫(yī)學二級學科博士學位授權(quán)點以及公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學一級學科和社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理二級學科碩士學位授權(quán)點，擁有公共衛(wèi)生碩士（MPH）專業(yè)學位授權(quán)點。擁有“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學”、“公共管理”和“環(huán)境因素與腫瘤”、“環(huán)境與健康”等8個省級重點學科和重點實驗室。公共衛(wèi)生學院現(xiàn)設有預防醫(yī)學、公共事業(yè)管理、食品質(zhì)量與安全、衛(wèi)生檢驗與檢疫等4個全日制本科專業(yè)。在校生1500余人，其中博、碩士生120余人。

悠久的辦學歷史奠定了公共衛(wèi)生學院高品質(zhì)的教學質(zhì)量和水平，公共衛(wèi)生學院“預防醫(yī)學專業(yè)”獲2009年國家級特色專業(yè)建設點、2012年福建省專業(yè)綜合改革試點專業(yè)；“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學實驗教學中心”為2013年國家級實驗教學示范中心；公共衛(wèi)生學院院同時擁有預防醫(yī)學省級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學省級實驗教學示范中心，衛(wèi)生毒理學、行政管理學等7門省級精品課程、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學等3個省級教學團隊以及預防醫(yī)學、公共管理2個省級大學生校外實踐教育基地；有福建省衛(wèi)計委、省出入境檢驗檢疫局、省市疾控中心、衛(wèi)生監(jiān)督所以及學校各附屬醫(yī)院、教學醫(yī)院等30余個校外專業(yè)和臨床教學實習基地。

公共衛(wèi)生學院科學研究成果喜人，曾先后獲得全國科學大會獎、北京市科技進步一等獎、福建省科技成果二、三等獎30多項。近五年來，公共衛(wèi)生學院先后承擔國家、省自然科學基金等70多項科研課題，發(fā)表科研論文400多篇，其中SCI收錄100余篇，出版專著70余部，獲科研項目經(jīng)費3000多萬元。公共衛(wèi)生學院廣泛參與國際或校際學術(shù)交流，數(shù)十人次留學、出訪歐、美、日等數(shù)十個國家和地區(qū)，并與日本長崎大學醫(yī)學部、臺灣嘉南藥理大學等建立了協(xié)作關(guān)系，每年選派優(yōu)秀青年教師、研究生和本科生交流學習。培養(yǎng)各類中高級預防醫(yī)學與全科醫(yī)學人才5000余人，為海峽西岸公共衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展做出了重要貢獻。