福建農林大學軟件學院創建于1993年，其前身為福建林學院計算中心；1995年7月成立計算機科學系；2000年10月，原福建農業大學與原福建林學院合并為福建農林大學；2001年5月將原福建林學院計算機科學系、基礎科學系高等數學教研室及原福建農業大學基礎部高等數學教研室、計算機教研室等合并成立福建農林大學軟件學院。

軟件學院堅持“質量立院、科技興院、人才強院、改革活院、文化建院”的辦學理念，堅持內涵發展、特色發展，穩步提升辦學質量。設有計算機科學與技術、統計學2個一級學科碩士點和計算機科學與技術、網絡工程專業、電子信息工程、軟件工程、數學與應用數學、統計學等6個本科專業，其中計算機科學與技術、網絡工程專業按大類招生。

【教研平臺】擁有“數字福建農林大數據研究所”、“智慧農林福建省高校重點實驗室”、“福建省資源環境空間信息統計研究中心”3個省級科研平臺以及“智慧農林和大數據研究中心”、“計算機應用研究所”等9個校級科研平臺。

【師資力量】目前全院在校學術型碩士研究生76人，本科生2024人；教職工182人，其中專職教師159人，教授16人、副教授53人；近年來，先后引進國家級人才2名、福建高層次人才4名，引進985院校博士17名，有博士學位教師67人；“閩江學者”講座教授7名、學校“金山學者”及省廳人才計劃達14人次;軟件學院教師主持國家自然基金22項；教育部人文社科基金4項，中國博士后基金5項，農業部國家重大農技推廣試點項目1項、福建省自然科學基金等省部級科研項目50多項，科研項目經費累計2000多萬元。

【國際合作交流】軟件學院學術交流與國際化辦學穩步推進，與加拿大戴爾豪西大學、美國奧特本大學、南非德班理工大學、英國亞伯大學、德國科布倫茨-蘭道大學等國外高校建立合作辦學關系，為師生合作研究交流、出國攻讀學位提供了良好條件。計算機科學與技術、軟件工程兩個專業2015年起被列入國家留學生基金委優秀本科生國際交流資助項目。

【人才培養】軟件學院注重培養學生創新創業能力，擁有1門國家精品在線開放課程，30多項國家級、省級大學生創新實驗項目；軟件學院堅持以文化人、實踐育人，堅持以賽促學、以賽促教，在“互聯網+”大學生創新創業大賽、全國大學生數學建模競賽、ACM國際大學生程序設計競賽、全國軟件和信息技術專業人才大賽、全國大學生市場調查與分析大賽等賽事中獲獎180多項。軟件學院生源質量好，畢業生專業就業對口率高、就業質量好，已為社會培養輸送了7000多名畢業生。