河南農業大學機電工程學院溯源于河南農學院1957年設立的農業機械化教研室，1960年成立農業機械化分院，1961年改為農業機械系，1985年易名為農業工程系，1993年更名為機電工程學院。

機電工程學院是河南農業大學建立最早的一個具有博士、碩士和學士學位以及專業碩士學位授予權的、多層次辦學的工科學院。機電工程學院經國家批準設有“農業工程博士后科研流動站”、農業工程一級學科博士、碩士學位授權點和農業生物環境與能源工程、農業機械化與裝備工程、農業電氣化與自動化、農產品物流技術與系統工程、農業水土工程、農業生物系統工程6個二級學科方向博士、碩士學位授權點，同時具有農業工程工程碩士、交通運輸工程碩士、動力工程工程碩士和農業機械化推廣碩士等4個專業學位授予權。擁有1個農業部重點學科“農業生物環境與能源工程”，1個河南省特色學科“農業工程”，1個校級重點學科“熱能與動力工程學科”。設有農業機械化及其自動化、農業建筑環境與能源工程、交通運輸、機械設計制造及其自動化、電子信息工程、能源與動力工程、汽車服務工程、新能源科學與工程、交通運輸（公路物流方向）、農業建筑環境與能源工程（農村能源方向）10個本科專業與方向，農業機械化及其自動化和能源與動力工程為一本招生專業。其中國家級特色專業1個、綜合改革示范專業1個，省級特色專業3個、綜合改革示范專業2個，校級特色專業4個。目前在校博士研究生、碩士研究生、本科生共2700余人。

機電工程學院現有教職工119人，教授12人，其中雙聘院士2人，講座教授1人，兼職教授12人，副教授33人，博士生導師15人，碩士生導師66人，具有博士學位46人，碩士學位以上占84%，享受國務院特殊津貼專家1人，國家級骨干教師1人，農業部科學技術委員會委員1人，省管優秀專家5人，省學術技術帶頭人7人，省級骨干教師7人。“可再生能源轉換與利用技術研究團隊”、“農業工程博士后科研創新團隊”為河南省“創新型科技團隊”，“可再生能源核心課程教學團隊”為河南省高等學校教學團隊。機電工程學院設有農業機械系、能源工程系、交通工程系、機械工程系、電氣工程系等5個系，1個河南農大工程科學實驗中心。擁有1個國家級實驗教學示范中心“農業工程訓練中心”，2個省級實驗教學示范中心“農業工程訓練中心”與“農業工程虛擬仿真實驗中心”。

依托機電工程學院建有農業部農村可再生能源新材料與裝備重點實驗室、生物質能源河南省“2011協同創新中心”、河南省可再生能源院士專家工作站、河南省可再生能源重點實驗室、河南省農村沼氣工程技術研究中心和農產品冷鏈物流信息與裝備技術河南省工程實驗室等6個省部級科研平臺。機電工程學院設有農業工程研究設計院，下設農業裝備、能源工程、物流工程、機電技術、農產品加工等5個研究所和16個研究室（設計室），建有國家人力資源和社會保障部農業行業特有工種職業技能鑒定站、農業部省柴節煤產品及設備檢驗測試中心、河南龍達汽車駕駛員培訓學校、河南省龍達科貿公司等教學科研平臺。機電工程學院同時也是中國農業工程學會、中國沼氣學會和全國高等學校工程熱物理研究會副理事長單位、河南省農業工程學會和河南省可再生能源學會理事長單位。

機電工程學院長期堅持“產、學、研”相結合的辦學思路，在農業工程核心領域保持了顯著的優勢，在可再生能源技術、農業裝備及自動化、交通運輸（物流）工程、機電一體化等領域形成了自己鮮明的研究特色。機電工程學院近年來承擔了國家自然科學基金、國家“863”計劃、國家科技支撐計劃、國家公益性行業（農業）科研專項、國家農業科技跨越計劃、國家農業科技成果轉化基金、國家農業產業崗位體系等國家級和省部級重點科技攻關項目100多項；公開發表國內外核心期刊學術論文800余篇，有200多篇論文被SCI、EI等收錄，單篇SCI影響因子最高達5.143；授權國家專利100多項。在解決國家及河南省所面臨的社會經濟及“三農”問題中發揮了積極作用，多項研究成果得到了轉化應用，產生了顯著的社會和經濟效益。

機電工程學院先后與美國堪薩斯州立大學、美國路易斯安那州立大學、德國萊比錫資源研究所、芬蘭VTT科學院、亞洲理工學院、韓國全北大學、韓國江原大學等國外高校及研究機構建立了學術交流和科研合作關系。